O projeto BRISA é financiado por diversas agências de suporte à pesquisa. Entre elas, podemos citar a Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP), que financiou a coleta de dados do pré-natal, nascimento e no segundo ano de vida; o Departamento de Ciência e Tecnologia da Secretaria de Ciência, Tecnologia e Insumos Estratégicos do Ministério da Saúde (DECIT/SCTIE/MS) que está financiando a fase atual da coleta (avaliação das crianças aos 10 anos) e o Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) que financiou parte dos equipamentos utilizados (inclusive da fase atual).
Além desses financiamentos, o Projeto BRISA Ribeirão Preto também conta com o apoio da Fundação de Apoio ao Ensino, Pesquisa e Assistência do HCFMRP-USP (FAEPA), da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP) e da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES).
